由於阿聯酋航空在2019年7月1日至19日間，幾次使用美國捷藍航空（JetBlue）的代號讓班機飛過伊朗的飛航情報區（FIR），遭美國運輸交通部（DOT）開罰40萬美元。時值阿聯酋航空因疫情取消許多班機，已退費十多億美元給廣大消費者，這次美方開罰又讓該公司帳單增添一筆。
美國與伊朗近年關係緊張，美國聯邦航空總署（FAA）也在2019年6月禁止美籍航空公司飛過伊朗。雖然理論上該項規定不適用境外的阿聯酋航空，但阿聯酋航空當時使用了捷藍航空的代號，因此仍受管轄。
對此阿聯酋航空發言人向媒體聲明表示，公司重視遵守政府管制，也遺憾因督導不周造成違規，事發後公司已積極配合改正與調查，也接受美國DOT的決定。阿聯酋航空需先在120日內支付20萬美元，此後若無再犯，剩餘罰款將可免除。
